Page 24 - Número Especial / Invierno 2016

Becas L’Oréal-Unesco-Conacyt-AMC

ARN no codificante y los procesos
de regulación genética

Menos del 3 % de los tres mil millones de pares de bases en Selene Lizbeth Fernández Valverde. Foto: L’Oréal.
el ADN humano codifican proteínas, mientras que el 62 % del
genoma humano se “copia” a ARN (ácido ribonucleico) que identificar los dominios de unión en estos arreglos de pro-
no genera proteínas —y al que se le llama no codificante— teínas, del lncRNA y en otros ARN largos no codificantes de
pero que cambia la expresión de los genes. los cuales no se han estudiado sus interacciones”.

Selene Lizbeth Fernández Valverde, del Laboratorio Otro aspecto será ver qué sucede cuando cambia la se-
Nacional de Genómica para la Biodiversidad (Langebio) cuencia alrededor del lncRNA, cómo se dobla y se pega a
del Cinvestav, indicó que cerca del 80 % de las mutaciones las proteínas, y con ello definir cuáles son los aspectos que
identificadas en cáncer, diabetes, y en la mayoría de los pade- intervienen en la interacción ARN-proteína.
cimientos humanos, están en regiones no codificantes.
Con la secuenciación de genomas los investigadores pue-
Algunas de estas moléculas que no codifican proteínas son den extraer toda la información contenida en una célula
los ARN largos no codificantes (lncARNs) y recientemen- (como es el ADN, el ARN o las proteínas), lo que significa
te se ha demostrado que participan en procesos celulares tener disponibles millones de secuencias que requieren para
fundamentales como son el mantenimiento de telómeros su estudio herramientas computacionales.
(los extremos de los cromosomas, asociados con el enve-
jecimiento), el silenciamiento del cromosoma X en mujeres; Ante esta “avalancha” de información genómica la bioin-
también se les ha relacionado con procesos de enfermedad formática permite analizar grandes cantidades de datos
como la metástasis del cáncer, en el caso del lncARN HO- biológicos e identificar patrones generales o específicos,
TAIR, a sitios de susceptibilidad a diabetes y al desarrollo de esto de manera automatizada, medible y reproducible.
enfermedades cardiovasculares, entre otros.
Cuando las tecnologías permitieron la secuenciación ma-
No se conoce bien cómo son los procesos de expresión siva, los investigadores encontraron que muchas áreas del
de los lncARN, al respecto la doctora Fernández Valverde genoma no están destinadas a codificar proteínas y que esto
trabaja en un proyecto para estudiar los dominios de pegado ocurre con el genoma de diversos organismos multicelulares,
a proteínas de ARNs largos no codificantes a través de mi- incluidos los seres humanos. Al identificar la alta prevalencia
croarreglos de proteínas. Se enfocará en un ARN largo no de estas moléculas, la bioinformática —que se refiere a las
codificante del cual se conocen sus interacciones con pro- herramientas computacionales para analizar datos biológi-
teínas. “Transcribiremos el lncARN in vitro y lo marcaremos cos— abrió una nueva área de estudio. Noemí Rodríguez
con un fluoróforo verde, una vez sintetizado el ARN se hibri-
dará a un microarreglo de proteínas humanas comercial, lo
que nos permitirá identificar a que proteínas se une”.

En un solo experimento quiere observar a cuáles de
las nueve mil proteínas del microarreglo se pega y ver si
concuerda con los datos que se tienen, lo que les permi-
tirá verificar si los resultados obtenidos in vivo se pueden
reproducir con un ARN sintetizado in vitro como plantea el
proyecto de Fernández, quien obtuvo una de las Becas para
las Mujeres en la Ciencia L´Oréal-Unesco-Conacyt-AMC 2016,
por su proyecto “Validación de la existencia de dominios de
pegado a proteínas en un RNA largo no codificante”.

“Una vez probado el sistema utilizaremos estos resul-
tados para obtener fondos y estudiar distintos lncRNAs
relacionados con el cáncer. La idea general del proyecto es

24 / Boletín informativo de la Academia Mexicana de Ciencias